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1、疫病爛果
由辣椒疫霉菌引起真菌病害。從苗期到成株危害果實，果實發病多從蒂部開始，病斑水漬狀向果面發展，似水燙狀，灰綠色，后變灰色軟腐，有稀疏的白霉。氣溫28到30℃、空氣濕度大易發此病。
防治：育苗期間和田間定植后應噴保護性藥劑，如用70%代森錳鋅可濕性粉劑500倍液7到10天噴1次。
2、炭疽病爛
炭疽病爛果除真菌侵染外，種植密度大，施用氮肥過多會引起此病，并加重該病的發生。
防治：合理密植，做好配方施肥，注意排水及通風排濕。藥劑防治上可用70%甲托可濕性粉劑500到600倍液防治。
3、軟腐病爛果
軟腐病爛果多在近果柄處發生，在萼筒周圍發生很小的水漬狀暗綠色的病斑擴展后整個果實變白，綠色，軟腐，果實內組織腐爛，病果呈水泡狀。
防治：用72%農用鏈霉素4000倍液或DT殺菌劑500倍液7天葉1次，連噴2到3次。
